MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239511
2	NC_017429	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239511
3	NC_017429	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239511
4	NC_017429	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239511
5	NC_017429	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	385239511
6	NC_017429	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239511
7	NC_017429	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239511
8	NC_017429	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239511
9	NC_017429	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239511
10	NC_017429	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385239511
11	NC_017429	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239511
12	NC_017429	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239511
13	NC_017429	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
14	NC_017429	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239512
15	NC_017429	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239512
16	NC_017429	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385239512
17	NC_017429	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385239512
18	NC_017429	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239512
19	NC_017429	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
20	NC_017429	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239512
21	NC_017429	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239512
22	NC_017429	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385239513
23	NC_017429	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239513
24	NC_017429	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385239513
25	NC_017429	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
26	NC_017429	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239513
27	NC_017429	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239513
28	NC_017429	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
29	NC_017429	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239513
30	NC_017429	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
31	NC_017429	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239513
32	NC_017429	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
33	NC_017429	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239513
34	NC_017429	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239513
35	NC_017429	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385239513
36	NC_017429	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	385239513
37	NC_017429	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
38	NC_017429	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239513
39	NC_017429	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239513
40	NC_017429	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385239513
41	NC_017429	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
42	NC_017429	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
43	NC_017429	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
44	NC_017429	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239513
45	NC_017429	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385239513
46	NC_017429	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385239513
47	NC_017429	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239513
48	NC_017429	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239513
49	NC_017429	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239513
50	NC_017429	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239513
51	NC_017429	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385239514
52	NC_017429	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239514
53	NC_017429	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
54	NC_017429	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385239514
55	NC_017429	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
56	NC_017429	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385239514
57	NC_017429	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
58	NC_017429	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385239514
59	NC_017429	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
60	NC_017429	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239514
61	NC_017429	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	385239514
62	NC_017429	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
63	NC_017429	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385239514
64	NC_017429	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	385239514
65	NC_017429	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239514
66	NC_017429	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385239514
67	NC_017429	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385239514
68	NC_017429	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
69	NC_017429	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239514
70	NC_017429	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239514
71	NC_017429	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239514
72	NC_017429	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239514
73	NC_017429	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385239514
74	NC_017429	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239514
75	NC_017429	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385239514
76	NC_017429	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385239514
77	NC_017429	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239514
78	NC_017429	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239514
79	NC_017429	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239515
80	NC_017429	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239515
81	NC_017429	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
82	NC_017429	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385239515
83	NC_017429	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239515
84	NC_017429	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385239515
85	NC_017429	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385239515
86	NC_017429	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239515
87	NC_017429	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
88	NC_017429	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385239515
89	NC_017429	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385239515
90	NC_017429	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
91	NC_017429	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
92	NC_017429	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
93	NC_017429	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239515
94	NC_017429	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239515
95	NC_017429	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239515
96	NC_017429	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385239515
97	NC_017429	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	385239515
98	NC_017429	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239515
99	NC_017429	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239515
100	NC_017429	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385239515
101	NC_017429	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239515
102	NC_017429	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239515
103	NC_017429	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239515
104	NC_017429	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	385239515
105	NC_017429	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	385239515
106	NC_017429	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239516
107	NC_017429	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239516
108	NC_017429	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	385239516
109	NC_017429	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	385239516
110	NC_017429	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239516
111	NC_017429	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239516
112	NC_017429	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239516
113	NC_017429	TCG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239517
114	NC_017429	TCC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239517
115	NC_017429	GTT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239517
116	NC_017429	AC	3	6	7648	7653	50 %	0 %	0 %	50 %	385239517
117	NC_017429	T	6	6	7684	7689	0 %	100 %	0 %	0 %	385239517
118	NC_017429	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385239517
119	NC_017429	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	385239517
120	NC_017429	TTA	2	6	7836	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239517
121	NC_017429	A	6	6	7968	7973	100 %	0 %	0 %	0 %	385239517
122	NC_017429	T	6	6	8053	8058	0 %	100 %	0 %	0 %	385239517
123	NC_017429	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239517
124	NC_017429	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	385239518
125	NC_017429	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239518
126	NC_017429	AG	3	6	8391	8396	50 %	0 %	50 %	0 %	385239518
127	NC_017429	ACC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239518
128	NC_017429	CTT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239518
129	NC_017429	CT	4	8	8510	8517	0 %	50 %	0 %	50 %	385239518
130	NC_017429	GAG	2	6	8564	8569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
131	NC_017429	ATA	2	6	8581	8586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239518
132	NC_017429	GT	3	6	8592	8597	0 %	50 %	50 %	0 %	385239518
133	NC_017429	AGG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239518
134	NC_017429	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	385239518
135	NC_017429	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	385239518
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